Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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