Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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NCOA4Q13772 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCOA4Q13772 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NCOA4Q13772 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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NCOA4Q13772 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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