Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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