Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms