Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF5Q13568 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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