Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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