Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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