Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLFQ13129 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLFQ13129 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLFQ13129 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RLFQ13129 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLFQ13129 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLFQ13129 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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