Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDZK1IP1Q13113 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms