Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1BQ13112 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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