Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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