Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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