Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.083e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.223e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.893e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-210ENST00000467943 546 ntTSL 224.05■■□□□ 1.444e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.414e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.14e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.964e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.634e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.1■□□□□ 0.174e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 515.16■□□□□ 0.024e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-11■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 322.4■■□□□ 1.182e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 36.35□□□□□ -1.392e-12■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MKL1-208ENST00000466278 577 ntTSL 322.72■■□□□ 1.232e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.312e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MKL1-207ENST00000463769 531 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-203ENST00000591969 742 ntTSL 315.71■□□□□ 0.112e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.082e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 EXT1-203ENST00000437196 1446 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 EXT1-202ENST00000436216 700 ntTSL 312.3□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AL139383.1-201ENST00000454681 892 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 58.75□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IQGAP2-217ENST00000514350 2617 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.162e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.832e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.014e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-208ENST00000532685 568 ntTSL 217.96■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-202ENST00000528070 856 ntTSL 517.86■□□□□ 0.454e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.174e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-204ENST00000530119 1191 ntTSL 211.65□□□□□ -0.544e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TALDO1-205ENST00000530440 710 ntTSL 310.83□□□□□ -0.684e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.594e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 25.71□□□□□ -1.54e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 WDR70-206ENST00000510699 690 ntTSL 53.64□□□□□ -1.834e-8■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 FAM169A-207ENST00000514215 5954 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.732e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.782e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.811e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.178e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.078e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 415.28■□□□□ 0.048e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.158e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 38.94□□□□□ -0.988e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 58.63□□□□□ -1.038e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27.62□□□□□ -1.198e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.298e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.48e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.518e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.718e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.758e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.818e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.848e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.848e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.878e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.491e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.591e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IL23R-204ENST00000473881 1507 ntTSL 1 (best)3.75□□□□□ -1.811e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.931e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 35.19□□□□□ -1.586e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 DCP2-207ENST00000513585 1572 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.974e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 DCP2-206ENST00000512751 570 ntTSL 37.52□□□□□ -1.214e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 218.55■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 511.61□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.59□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.51□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.43□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.17□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.131e-6■■■□□ 17.7
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 145.2 ms