Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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