Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIAQ12857 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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