Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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STX4Q12846 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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STX4Q12846 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STX4Q12846 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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