Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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GTF3C1Q12789 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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GTF3C1Q12789 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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GTF3C1Q12789 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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GTF3C1Q12789 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GTF3C1Q12789 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C1Q12789 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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