Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms