Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms