Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms