Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms