Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDR1Q08345 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDR1Q08345 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms