Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms