Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms