Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms