Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSME1Q06323 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms