Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms