Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms