Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms