Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAV1Q03135 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms