Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP2BQ02880 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.9 ms