Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms