Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms