Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms