Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms