Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms