Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms