Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFKB2Q00653 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms