Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms