Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPM4P67936 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms