Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB1P62873 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB1P62873 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms