Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms