Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms