Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB2AP61019 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms