Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA9P57773 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA9P57773 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms