Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL23P55773 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL23P55773 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL23P55773 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL23P55773 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL23P55773 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL23P55773 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL23P55773 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL23P55773 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms