Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms