Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms