Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COPAP53621 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPAP53621 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPAP53621 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPAP53621 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPAP53621 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPAP53621 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms