Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX2-5P52952 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms